Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms