Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms