Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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