Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rph3alQ768S4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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