Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms