Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RfflQ6ZQM0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RfflQ6ZQM0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RfflQ6ZQM0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RfflQ6ZQM0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RfflQ6ZQM0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RfflQ6ZQM0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RfflQ6ZQM0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RfflQ6ZQM0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RfflQ6ZQM0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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