Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms