Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Cxcl3Q6W5C0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Cxcl3Q6W5C0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Cxcl3Q6W5C0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Cxcl3Q6W5C0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Cxcl3Q6W5C0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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