Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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Atp8b3Q6UQ17 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b3Q6UQ17 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b3Q6UQ17 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Atp8b3Q6UQ17 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Atp8b3Q6UQ17 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Atp8b3Q6UQ17 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Atp8b3Q6UQ17 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Atp8b3Q6UQ17 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Atp8b3Q6UQ17 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Atp8b3Q6UQ17 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms