Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms