Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms