Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms