Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms