Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm2lQ6PDS0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms