Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms