Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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