Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms