Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp49Q6P9L4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms