Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms