Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms