Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms