Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc66Q6NS45 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms