Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt87Q6IMF0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms