Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt39Q6IFX4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt39Q6IFX4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt39Q6IFX4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt39Q6IFX4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt39Q6IFX4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt39Q6IFX4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt39Q6IFX4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt39Q6IFX4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt39Q6IFX4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt39Q6IFX4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt39Q6IFX4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms