Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms