Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms