Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms