Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Msl2Q69ZF8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Msl2Q69ZF8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msl2Q69ZF8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms