Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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