Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knl1Q66JQ7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Knl1Q66JQ7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knl1Q66JQ7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knl1Q66JQ7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knl1Q66JQ7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knl1Q66JQ7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knl1Q66JQ7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knl1Q66JQ7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knl1Q66JQ7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knl1Q66JQ7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms