Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf1Q64213 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sf1Q64213 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf1Q64213 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf1Q64213 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf1Q64213 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf1Q64213 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf1Q64213 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf1Q64213 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf1Q64213 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf1Q64213 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf1Q64213 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf1Q64213 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf1Q64213 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf1Q64213 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf1Q64213 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms