Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Trim24Q64127 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms