Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ScxQ64124 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms