Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
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