Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms