Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms