Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf260Q62513 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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