Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CochQ62507 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms