Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnrpcQ62241 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnrpcQ62241 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnrpcQ62241 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms