Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms