Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms