Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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