Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms