Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad21Q61550 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms