Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms