Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde3bQ61409 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde3bQ61409 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde3bQ61409 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde3bQ61409 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde3bQ61409 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde3bQ61409 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms