Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hif1aQ61221 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms