Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a1Q61165 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms