Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc6Q61143 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms