Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Cln3Q61124 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Cln3Q61124 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Cln3Q61124 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Cln3Q61124 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Cln3Q61124 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Cln3Q61124 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Cln3Q61124 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Cln3Q61124 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Cln3Q61124 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Cln3Q61124 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms